O Simples Nacional para clínicas parece a escolha óbvia de quem abre um consultório. Além disso, a guia é única, a burocracia é menor e a alíquota inicial é baixa. Com a Reforma Tributária, porém, a conta ficou mais complexa. Por isso, vale entender quando o Simples compensa e quando outro regime paga menos.
Neste guia, você vê como funcionam os anexos, o Fator R e a comparação com o Lucro Presumido. Também confere três exemplos numéricos, o efeito do IBS e da CBS e um plano em cinco passos para decidir com segurança.
O que você vai aprender nesse conteúdo:
ToggleSimples Nacional para clínicas: o tamanho do tema
Primeiro, o Simples é o regime da maioria das empresas brasileiras. Segundo o AmdJus, em texto de setembro de 2025, com dados atribuídos à Receita Federal, havia 7.348.088 empresas no Simples Nacional. Elas representavam 28,6% do total.
Contudo, o número é uma contagem de registros, sem ano de referência na fonte. Além disso, nem todas essas empresas atuam na saúde. Mesmo assim, o dado mostra a escala do regime e explica por que tantas clínicas pensam nele.
Para uma clínica médica, a pergunta é mais específica. Então, o Simples paga menos do que o Lucro Presumido? A resposta depende do faturamento, da folha de pagamento e do tipo de procedimento. Por isso, não existe regra única.
Como o Simples Nacional para clínicas médicas funciona
Na prática, a clínica médica no Simples fica no Anexo III ou no Anexo V. Segundo a Contabilidade Zen, em texto de 30 de junho de 2026, o Fator R decide o anexo. Assim, se o Fator R for de 28% ou mais, vale o Anexo III. Se for menor, vale o Anexo V.
Segundo a Agilize, em texto de 6 de agosto de 2026, a primeira faixa tem alíquota de 6% no Anexo III. Porém, no Anexo V, ela é de 15,5%. A diferença é de 9,5 pontos percentuais.
Portanto, a escolha do anexo vale mais do que quase qualquer outro ajuste. Com isso, uma clínica que cai no Anexo V paga bem mais do que uma que cumpre o Fator R. Por isso, o cálculo da folha é o centro da decisão.
O Fator R de 28% no Simples Nacional para clínicas
O Fator R é a folha dos últimos 12 meses dividida pela receita bruta do mesmo período. Segundo a Agilize, a folha inclui o pró-labore. Além disso, o cálculo é refeito todo mês. Por sua vez, a Contabilidade Zen cita também salários, 13º, férias e FGTS.
Segundo a mesma fonte, a distribuição de lucros e os pagamentos a médicos PJ ou autônomos não entram no cálculo. De fato, isso importa para clínicas que contratam médicos como pessoa jurídica. Nesse caso, a folha pode ficar abaixo de 28%.
Assim, a clínica precisa decidir como remunera a equipe, e isso afeta o enquadramento de forma direta. Um pró-labore maior eleva o Fator R, mas também aumenta o INSS do sócio. Por isso, a decisão exige uma conta que compare os dois efeitos.
Exemplo prático 1. Uma clínica fatura R$ 15.000 por mês, ou R$ 180.000 em 12 meses, na primeira faixa. Nesse caso, para chegar a 28%, o pró-labore teria de ser de R$ 4.200 por mês. No Anexo III, o imposto seria de 6%, ou R$ 900. Por outro lado, no Anexo V, seria de 15,5%, ou R$ 2.325. A economia é de R$ 1.425. Depois, com 11% de INSS sobre o pró-labore, ou R$ 462, o ganho líquido é de R$ 963 por mês.
Simples Nacional para clínicas e o Lucro Presumido
A comparação mais comum é com o Lucro Presumido. Segundo a Contabilidade Zen, a R$ 100 mil por mês a alíquota efetiva seria de cerca de 11,2% no Anexo III. Mas no Anexo V, seria de 17,8%.
A fonte conclui que, sem equiparação hospitalar, o Simples no Anexo III vence até cerca de R$ 150 mil por mês. Por sua vez, com equiparação, o Lucro Presumido passaria a compensar a partir de cerca de R$ 60 mil por mês. São estimativas de um texto de marketing, e elas podem conter inconsistências.
Portanto, use esses números só como ponto de partida. A decisão real depende do faturamento, da folha, dos custos e da cidade. Por isso, peça ao contador uma simulação com os dados da sua clínica.
A equiparação hospitalar muda a conta
A equiparação hospitalar reduz a base de presunção do Lucro Presumido. Na prática, segundo a Contabilidade Zen, a base cai de 32% para 8% no IRPJ e para 12% na CSLL. A fonte estima uma carga de cerca de 8,93%, contra 14,33% sem o benefício.
Mas nem toda clínica tem direito. Em geral, segundo a mesma fonte, a regra vale para clínicas que realizam procedimentos além da simples consulta e que cumprem as exigências da Anvisa. Uma clínica de consultas não deve contar com ela.
Assim, o perfil da clínica pesa muito. Por exemplo, uma clínica de procedimentos tende a olhar o Lucro Presumido com atenção. Uma clínica de consultas tende a ficar melhor no Simples, no Anexo III, se cumprir o Fator R.
Simples Nacional para clínicas e o limite de faturamento
Contudo, o Simples tem teto. Segundo a Contabilidade Zen, o limite de receita é de R$ 4,8 milhões por ano. Portanto, uma clínica que cresce perto desse valor precisa planejar a saída do regime.
Quando o faturamento sobe, a alíquota efetiva também sobe. Em algum ponto, o Simples deixa de ser vantajoso, mesmo dentro do limite. Ou seja, esse ponto varia. Por isso, faça a simulação todo ano.
Por isso, a clínica em crescimento deve revisar o regime antes de passar de faixa. Quem espera o limite chegar perde a chance de planejar. Além disso, a mudança de regime exige ajustes no sistema e nos contratos.
Folha, pró-labore e médicos PJ
Primeiro, a folha de pagamento é a peça central do Fator R. Muitas clínicas pagam pouco pró-labore e distribuem lucros para reduzir o INSS. Porém, esse desenho pode derrubar o Fator R e levar a clínica ao Anexo V.
Por outro lado, aumentar o pró-labore eleva o INSS do sócio. A conta correta compara a economia do Anexo III com o custo extra de INSS. Em geral, a diferença de alíquota é grande o bastante para compensar, mas isso depende do faturamento.
Além disso, a forma de contratar os médicos importa. Por exemplo, segundo a Contabilidade Zen, pagamentos a médicos PJ não entram na folha do Fator R. Por outro lado, o salário de empregados entra. Portanto, a escolha entre contratar por CLT ou por PJ muda o índice e o imposto.
Por fim, acompanhe o Fator R todo mês, e não só no fim do ano. Como ele considera os últimos 12 meses, uma queda na folha leva tempo para aparecer. Assim, a clínica ganha prazo para corrigir antes de pagar mais.
Sociedade simples e ISS fixo
Além disso, há a opção da sociedade simples. Segundo a Contabilidade Zen, esse formato pode permitir o ISS fixo por sócio em alguns municípios. Porém, ele exclui a equiparação hospitalar.
Segundo a Cora, em texto de 3 de novembro de 2026, as sociedades uniprofissionais com ISS fixo perdem esse benefício aos poucos até 2033. Elas tendem a ter o maior aumento de carga com a reforma.
Portanto, o ISS fixo não é uma solução de longo prazo. Por isso, a clínica que o usa hoje deve projetar a perda até 2033. Essa conta pode mudar a forma societária mais adequada.
Simples Nacional para clínicas e a Reforma Tributária
Na prática, a reforma muda o Simples a partir de 2027. Segundo a Cora, no regime único, o IBS e a CBS ficam dentro do DAS, sem aproveitamento de crédito. Por outro lado, no regime híbrido, o DAS cobre IRPJ, CSLL e CPP, e o IBS e a CBS são pagos por fora, com crédito.
Segundo o Meu Contador Online, em texto de 17 de agosto de 2026, os demais tributos seguem no Simples. Por fim, em 2027, a CBS substitui o PIS e a Cofins, e o IBS entra com 0,1% em 2027 e 2028.
A Cora afirma que, nas faixas baixas, o regime único tende a ser melhor. Ainda segundo ela, em um exemplo de R$ 15 mil por mês, o híbrido custaria cerca de 75% a mais. Nas faixas altas, com créditos ou clientes empresa, o híbrido pode compensar.
Quando o regime híbrido compensa
De fato, o crédito é o centro da decisão. Segundo o Meu Contador Online, o híbrido tende a fazer sentido quando a empresa vende para outras empresas e tem compras tributadas relevantes. Por outro lado, clientes pessoas físicas normalmente não valorizam o crédito.
Na clínica, isso depende de quem paga. Por exemplo, o paciente particular não aproveita crédito. Por outro lado, a empresa que contrata exames ocupacionais ou convênios pode valorizar o destaque. Assim, o perfil de clientes pesa na escolha.
Exemplo prático 2. Uma clínica fatura R$ 100.000 por mês. Nesse caso, com a alíquota hipotética de 11,2% na saída, o débito de IBS e CBS é de R$ 11.200. Se ela compra R$ 30.000 de materiais e serviços com alíquota hipotética de 28%, o crédito é de R$ 8.400. Assim, o imposto líquido é de R$ 2.800, ou 2,8%. Com apenas R$ 5.000 de compras, o crédito é de R$ 1.400, e o imposto líquido sobe a R$ 9.800, ou 9,8%.
Os prazos de opção no Simples Nacional para clínicas
Além disso, o prazo pesa muito agora. Segundo a Cora, a opção para o primeiro semestre de 2027 venceu em 30 de outubro de 2026, pela Resolução CGSN nº 194/2026. Depois, o cancelamento irretratável vale de 3 de novembro a 20 de dezembro de 2026.
Ainda há previsão de nova janela em março de 2027. O Meu Contador Online, em texto anterior, falava em cancelamento até o fim de novembro. Por isso, como as fontes divergem, confirme a data no Portal do Simples Nacional.
Portanto, a clínica que ainda não decidiu deve agir sem demora. Peça ao contador a simulação dos dois regimes. Depois, escolha com os números reais, e não com a regra geral.
Pacientes particulares, convênios e empresas
De fato, o perfil de receita muda tudo. A clínica que atende só particulares tende a preferir o regime único, porque o crédito pesa menos. Por outro lado, a clínica que atende convênios e empresas pode ter motivo para olhar o híbrido.
Segundo a Cora, os prazos de 60 a 120 dias dos convênios pressionam o caixa. Com isso, o split payment também altera o fluxo. Assim, a escolha do regime deve considerar o efeito no capital de giro, e não só a alíquota.
Também importa o contrato com o convênio. Cláusulas de reequilíbrio tributário protegem a clínica de mudanças de carga. Por isso, revise os contratos antes de decidir o regime.
Exemplo prático 3. Uma clínica fatura R$ 100.000 por mês. Nesse caso, segundo as estimativas da Contabilidade Zen, a alíquota efetiva seria de cerca de 11,2% no Anexo III e de 17,8% no Anexo V. O imposto seria de R$ 11.200 contra R$ 17.800. Portanto, a diferença de R$ 6.600 por mês mostra o valor de cumprir o Fator R.
Quando o Simples Nacional para clínicas vale a pena
Em resumo, o Simples Nacional para clínicas tende a valer a pena em alguns perfis. Uma clínica pequena, com faturamento moderado e Fator R de 28% ou mais, costuma ficar bem no Anexo III. Assim, ela ganha simplicidade e uma alíquota competitiva.
Por outro lado, a clínica de procedimentos, com equiparação hospitalar e faturamento alto, deve olhar o Lucro Presumido. A clínica que cresce perto do teto deve planejar a saída. A clínica com muitos clientes empresa deve avaliar o híbrido.
Portanto, em todos os casos, a regra é simular. Nenhuma fonte substitui os números da sua clínica. Pois o melhor regime de um colega pode não ser o seu.
A visão de Luiz Rainato sobre o Simples Nacional para clínicas
Para Luiz Rainato, diretor e fundador da R2 Saúde Contábil, o maior erro é escolher o regime por hábito. Na prática, segundo ele, muitas clínicas ficam no Simples porque sempre estiveram lá, sem refazer a conta.
Além disso, ele destaca que a reforma exige uma nova comparação. Em sua visão, o crédito de IBS e CBS e o perfil de clientes entram na equação, e isso muda o resultado de muitas clínicas.
Por fim, Luiz Rainato recomenda revisar o regime todo ano. Dessa forma, para ele, a clínica que simula com regularidade decide com calma e evita surpresa.
Erros comuns sobre o Simples Nacional para clínicas
O primeiro erro é presumir que o Simples sempre paga menos. Porém, para clínicas de procedimentos com equiparação, o Lucro Presumido pode vencer. Por isso, compare os regimes com números reais.
Em seguida, há o erro de ignorar o Fator R. Uma clínica que cai no Anexo V sem perceber paga muito mais. Assim, o acompanhamento mensal da folha é indispensável.
Por sua vez, outro erro é contratar médicos como PJ sem medir o efeito na folha. Segundo a Contabilidade Zen, pagamentos a médicos PJ ou autônomos não entram no Fator R. Assim, isso pode derrubar o índice abaixo de 28%.
Por fim, muitas clínicas deixam o prazo de opção passar. Em um regime semestral, a janela perdida significa meses com a regra errada. Por isso, acompanhe o calendário do Simples.
Plano em cinco passos para decidir o regime
Primeiro, calcule o Fator R atual da clínica. Em seguida, estime o imposto nos Anexos III e V e no Lucro Presumido, com e sem equiparação hospitalar. Depois, simule o IBS e a CBS nos regimes único e híbrido, com os créditos reais.
Também revise os contratos com convênios e a gestão de caixa. Por fim, decida dentro do prazo e registre a escolha com as premissas usadas. Dessa forma, o Simples Nacional para clínicas deixa de ser hábito e vira estratégia.
Perguntas frequentes sobre o Simples Nacional para clínicas
Clínica médica pode ficar no Simples Nacional?
Segundo as fontes consultadas, sim, dentro do limite de R$ 4,8 milhões por ano e no Anexo III ou V. Confirme as vedações do seu caso com o contador.
O que é o Fator R?
É a folha dos últimos 12 meses dividida pela receita bruta do mesmo período. Com 28% ou mais, a clínica fica no Anexo III. Com menos, vai ao Anexo V.
O Simples sempre paga menos que o Lucro Presumido?
Não. Segundo a Contabilidade Zen, o Lucro Presumido com equiparação hospitalar pode compensar a partir de cerca de R$ 60 mil por mês. A conta depende do perfil da clínica.
Devo optar pelo regime híbrido em 2027?
Depende do crédito e dos clientes. Segundo a Cora, nas faixas baixas o regime único tende a ser melhor. Simule com os seus números e confirme os prazos.
Sua clínica já sabe se o Simples ainda compensa?
Em geral, quem cuida de pacientes vive o ritmo da agenda, e a escolha do regime costuma ficar parada por anos. Assim, a clínica paga mais do que deveria ou perde o prazo de opção. Sem simulação, a decisão vira palpite.
Na prática, a R2 Saúde Contábil acompanha a regulamentação da Reforma Tributária para profissionais da saúde. Assim, ajudamos você a calcular o Fator R, comparar os regimes e escolher entre o regime único e o híbrido. Além disso, veja o nosso guia da Reforma Tributária em 2026.
Fale com a R2 Saúde Contábil e simule hoje o melhor regime para a sua clínica.
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Luiz Rainato






